SuperAPI AI 工具集

metabolomics research

写作与研究

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更新于 10-16 01:16

技能介绍

用途:面向代谢组学研究的分析技能,用于代谢物识别与注释、研究信息检索、研究关键词搜索,并输出结构化研究报告。

主要能力:采用四阶段流程。第一阶段按名称在 HMDB 中检索代谢物,获取 HMDB ID、化学式、分子量、描述与通路,HMDB 不可用时回退到 PubChem 获取 CID 与化学性质。第二阶段根据研究 ID 检索研究元数据,前缀 MTBLS 对应 MetaboLights,ST 对应 Metabolomics Workbench。第三阶段按关键词搜索 MetaboLights 研究并返回匹配 ID 与预览。第四阶段输出数据库概览、近期研究样本与统计信息。

使用方式:输入可选参数包括 metabolite_list(代谢物名称列表)、study_id(如 MTBLS1 或 ST000001)、search_query(如 diabetes)、organism(默认 Homo sapiens)和 output_file(.md 报告路径)。工具自动从 ToolUniverse 加载,无需手动配置。HMDB 为 SOAP 工具,需传 operation 参数(HMDB_search 用 operation="search",HMDB_get_metabolite 用 operation="get_metabolite")。报告采用渐进式写入,边分析边追加内容。

适用场景:代谢物注释与通路分析、研究数据发现与检索、多数据库代谢组学查询、综合研究报告生成。

限制:HMDB 可能缺少部分代谢物,会回退 PubChem;部分研究需认证或未公开;报告对超过 10 个代谢物的列表自动截断;API 速率限制可能影响大规模查询;部分数据库工具需要 API 密钥,多数代谢组学工具无需密钥。缺失字段以 N/A 表示。