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genomics-viz

数据与分析

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更新于 10-16 00:02

技能介绍

用途:为 vault 的 docs/ GitHub Pages 站点构建遗传学与基因组学概念的交互式 D3 可视化。每个图是教学对象而非装饰,只服务于一条常青笔记中的单一遗传学主张;仅当动效或交互能完成静态图做不到的教学时才使用交互。

主要能力:提供概念到图表形式的目录,包括 Hardy–Weinberg 平衡、等位基因频率漂移、LD 衰减、重组、加性与显性方差、育种者方程、GxE 反应规范、基因组预测准确率、群体结构 PCA、Manhattan 图、亲缘/G 矩阵热图,并给出各自的编码主轴与教学交互。提供编码指导(位置→长度→角度/斜率→面积→色相/饱和度的精度层级、前注意属性只用一个焦点、Manhattan 图用交替灰、热图用单色顺序色带、色盲安全调色板、直接标注优先于图例)、注释层(标题写结论、标注焦点、引导阅读顺序、诚实框架)、无障碍要求(figure/figcaption、SVG title/desc、颜色非唯一载体、键盘可达、WCAG AA、静态回退)以及 docs/ 目录布局约定。

使用方式:从常青笔记出发写结论式标题,选目录行并确定一个教学交互;用 d3-visualization 做数据与比例尺,用小型透明带种子的模型模拟遗传学数据以保证可复现;应用编码与注释层;用 cognitive-design 自检后交由 cognitive-design-architect 代理评审,修复至通过再提议发布。

适用场景:需要向已有代数但缺乏直觉的读者解释遗传学概念的静态站点教学图。

限制:本技能只产出或修订 docs/ 下文件,仅提议不自行提交或发布,需作者批准;机制依赖 d3-visualization、visual-storytelling-design、cognitive-design 三个技能;若交互无助于主张则应发布静态图。具体安装命令与收费信息暂未提供。