用途：把代码库索引成分层图（tree-sitter AST → SQLite），通过 MCP 工具做依赖分析、路径追踪、API 影响、引用、实现、诊断与架构概览。适用于接手陌生代码库、重构函数/类前分析、理解调用流、快速查找符号。
主要能力：index_project 建立索引（幂等，自动跳过未变更文件）；find_symbols 按名称查找；inspect_symbol 查看符号上下文；trace_paths 追踪依赖与调用（支持 mixed/calls、forward/reverse）；find_references、find_implementations；trace_dataflow 分析数据流（需 source.anchor，可选 sink.anchor，锚点类型 param/local/return/property）；api_impact 评估路由影响；analyze_architecture 查看架构与循环依赖；audit_workspace 查重复代码、热点、未用导出；diagnose_graph 检查图谱健康；analyze_changes 审查 diff；analyze_edit_region 评估编辑影响。语义工具只接受一个选择器：symbol_id、workspace_qualified_name、qualified_name 或 name+file。find_symbols 仅按名称发现，代码片段用 grep_search。结果被截断时应缩小 path 或改用 name+file。
使用方式：在 .mcp.json 配置 hex-graph MCP 服务器，command 为 node，args 为 {skills_repo}/mcp/hex-graph-mcp/server.mjs。输入 project_path 必填，command 可选（index、search、symbol、paths、refs、arch）。优先用 hex-graph 处理符号身份、引用、实现、架构、数据流、编辑影响；本地读取可用 hex-line。MCP 不可用时退回 Glob/Grep/Read/Bash 并说明置信度下降。
支持语言：JavaScript、TypeScript/TSX 语义覆盖最强；Python、C#、PHP 支持工作区级定义、调用、导入等，安装 provider 后可选精确覆盖。
限制：MCP 不可用或未索引时需手动回退；部分语言精确覆盖依赖 provider；资料未提供收费、价格、平台与效果信息。