用途：在学术书籍项目中索引、遍历或查询结构性关系，例如 Obsidian Vault、CPMK 先修网络、文献集合或代码库 AST，同时避免浪费模型上下文 token。
主要能力：支持 index、query、clean 三种动作；查询类型包括 summary、search、neighbors、shortest_path；输出 graph.json、graph.html、GRAPH_REPORT.md 等图谱产物，以及匹配节点、邻居或最短路径结果。
使用方式：通过 CLI 调用独立 Python 脚本，例如索引当前项目：python .codex/skills/scripts/graphify_harness.py index --project-dir "/path/to/project"；按关键词查询：python .codex/skills/scripts/graphify_harness.py query --project-dir "/path/to/project" --query-type search --target "CPMK-1"；查询邻居：python .codex/skills/scripts/graphify_harness.py query --project-dir "/path/to/project" --query-type neighbors --target "section:bab1.md#Pendahuluan"；清理缓存：python .codex/skills/scripts/graphify_harness.py clean --project-dir "/path/to/project"。
隔离与安全：图谱产物必须存放在 <project_dir>/.graphify/ 内，禁止跨项目混用；自动将 .graphify/ 加入项目 .gitignore；索引完全在本地通过确定性 AST 解析运行，不向外部云服务器发送凭据、私有文本或 API 密钥。
协作场景：book-author-orchestrator 在新书项目上运行预检索引；academic-source-analyzer 与 research-synthesis-to-reference-book 查询图谱聚类以按主题分组论文/笔记；rps-to-buku-ajar 通过 shortest_path 遍历 CPMK 先修链；academic-chapter-writer 查询邻居实现章节间自动交叉引用；citation-integrity-reviewer 从草稿文本回溯到证据片段节点以验证主张来源。
限制：资料未提供具体安装步骤、依赖版本、支持的文件格式细节、性能指标或收费信息。