用途：gnomAD 是公开的人类遗传变异集合，用于查询人群等位基因频率、变异约束分数（pLI、LOEUF）及功能缺失不耐受性。gnomAD v4 含 730,947 人外显子组、76,215 人基因组数据，覆盖多祖先人群。
主要能力：按基因或基因组位置查询变异；查询特定变异详情（AF、AC、AN、ac_hom、人群分层频率、consequence、lof、rsids、in_silico_predictors、clinvar_variation_id）；查询基因约束分数（exp/obs、oe_lof、pLI、mis_z、syn_z、LOEUF）；查询结构变异（gnomAD-SV）；支持外显子与基因组数据对比。数据集包括 gnomad_r4（默认，GRCh38）、gnomad_r4_genomes、gnomad_r3、gnomad_r2_1（GRCh37）。
使用方式：通过 GraphQL API https://gnomad.broadinstitute.org/api 以 POST 请求提交查询，示例用 Python requests 发送 gene、variant、gnomad_constraint、structural_variants 等查询。也可用浏览器 https://gnomad.broadinstitute.org/ 交互浏览，或从 https://gnomad.broadinstitute.org/downloads 下载 VCF、Hail 表、约束表，Google Cloud 路径为 gs://gcp-public-data--gnomad/。人群 ID 包括 afr、ami、amr、asj、eas、fin、mid、nfe、sas、remaining。
适用场景：变异致病性评估（BA1/BS1/PM2 等 ACMG 证据）、罕见病变异筛选、基因约束与单倍剂量不足分析、人群遗传学研究、祖先分层频率比较。
限制：资料未提供收费或价格信息；未在 gnomAD 中观察到变异不等于致病；外显子与基因组数据覆盖不同；GraphQL 查询需注意速率限制并添加延迟；v2 仅用于 GRCh37 兼容；pLI 对样本量敏感，LOEUF 更受推荐。引用：Karczewski KJ et al. (2020) Nature. PMID: 32461654；Chen S et al. (2024) Nature。