用途：面向以累积研究为目标的仓库，而非一次性问答。按 ref/ → docs/wiki/ → docs/public/ 单向流水线工作，保留来源证据并编译成持久 wiki，仅在证据状态清楚时发布可移植 HTML。
主要能力与结构：ref/ 存放论文、数据集、扫描件、归档与来源记录，保持不可变；ref/inbox/ 为用户提供文件的可变入口，识别并移出后即在 ref/ 下变为不可变；plans/notes/notebook/ 为低摩擦草稿区，允许零散想法、提纲、会议记录等，不视为证据；docs/wiki/ 为维护的综述层，含概念、实体、来源笔记、证据地图、问题、猜想与矛盾；docs/public/ 为发布输出，docs/public/index.html 为公开目录，exploratory/ 放可发布工作报告与证据浏览器，treatise/ 放从 wiki 综述成熟的论文式成果；plans/to-do/sources.md 为来源获取队列。
使用方式：改动前先读仓库，用 rg --files 或 find 检查目录，阅读 AGENTS.md、README.md、SKILL.md、ref/README.md、docs/wiki/index.md、docs/wiki/log.md 等；沿用既有命名、链接语法与清单字段。新仓库可创建最小脚手架，包括 ref/manifests/、ref/inbox/、plans/notes/notebook/、docs/wiki/index.md、docs/wiki/log.md、docs/public/index.html、docs/public/exploratory/、docs/public/treatise/、plans/to-do/sources.md。摄取时识别 ref/inbox/ 文件、按约定重命名、移入 ref/ 相应位置、更新清单与校验和（优先 SHA-256）、满足愿望清单则标记为已找到、更新 wiki 可发现性、在 docs/wiki/log.md 追加日期条目并清空 inbox。
限制：不得原地编辑已下载或用户提供的来源文件；强主张必须引用参考文件、清单、来源页或数据集，否则应写入来源队列而非当作定论；发布物应为自包含单页 HTML，内联 CSS 与 JS，不依赖外部 CDN、远程样式表、远程脚本或网页字体；成熟论文式发布只能来自已完成的 wiki 综述，并需先核实主张、关联支持与矛盾来源、记录决定；不得把 notebook 草稿当作来源引用；避免重复页面，优先扩展已有综述。其余细节暂未提供。