用途：该技能提供对 protocols.io API v3 的完整集成，用于以编程方式管理科学实验方案（protocols），覆盖方案发现、创建、更新、发布、协作、文件与实验记录等场景。
主要能力：
- 认证与访问：使用访问令牌或 OAuth 流程，支持生成授权链接、交换授权码、刷新令牌、管理速率限制与权限。
- 方案操作：按关键词、DOI 或分类搜索方案；获取含步骤的详细内容；创建、更新、发布方案并签发 DOI；管理步骤与材料试剂；收藏方案；生成 PDF。
- 讨论与协作：查看方案级和步骤级评论，创建评论与嵌套回复，编辑或删除自己的评论。
- 工作区管理：列出和访问工作区，查看成员与权限，申请加入，列出或创建团队方案。
- 文件操作：搜索、上传、下载、组织、更新元数据、删除与恢复文件。
- 附加功能：管理个人资料、查询近期发布方案、创建实验记录、接收通知、导出组织数据。
使用方式：所有请求基址为 https://protocols.io/api/v3，需在请求头加入 Authorization: Bearer YOUR_ACCESS_TOKEN。多数端点支持 JSON，并可通过 content_format 参数选择 json、html 或 markdown 格式。速率限制方面，标准端点约每分钟 100 次，PDF 端点每分钟 5 次（已登录）或 3 次（未登录），遇到 HTTP 429 应使用指数退避重试。技能按任务提供参考文件：authentication.md、protocols_api.md、discussions.md、workspaces.md、file_manager.md、additional_features.md。
适用场景：方案检索与引用、创建并发布带 DOI 的方案、团队工作区协作、实验执行记录与数据上传、方案集合备份迁移，以及构建与 protocols.io 交互的工具。
限制：需自行获取有效访问令牌并妥善保管；权限受工作区角色与方案可见性约束；文件上传受大小与类型限制；具体端点参数、错误码与完整示例需查阅对应参考文件及官方 API 文档 https://apidoc.protocols.io/。