Biomni 是一个开源的生物医学 AI 智能体框架，来自斯坦福 SNAP 实验室，用于自主执行跨生物医学领域的复杂研究任务。它适合多步生物学推理、生物医学数据分析，以及覆盖基因组学、药物发现、分子生物学和临床分析的研究工作。
主要能力包括：多步生物学推理，可自主分解与规划复杂查询；代码生成与执行，动态创建数据分析流程；知识检索，可访问约 11GB 的集成生物医学数据库与文献；跨域问题求解，提供基因组学、蛋白质组学、药物发现和临床任务的统一接口。典型用途涵盖 CRISPR 筛选设计、单细胞 RNA-seq 分析、药物 ADMET 预测、GWAS 分析、临床基因组学与实验室方案设计。
使用方式：先通过 uv pip install biomni --upgrade 安装，并配置 LLM 提供方 API 密钥（环境变量或 .env），如 export ANTHROPIC_API_KEY="your-key-here"。核心接口为 A1 类，基本流程是先以数据路径和 LLM 模型初始化 agent，再用自然语言调用 go() 执行任务，最后用 save_conversation_history() 保存结果（如 PDF）。可通过 default_config 调整 llm、timeout_seconds、max_iterations 等配置。支持 Anthropic、OpenAI、Azure、Google、Groq、AWS Bedrock 等提供方。数据湖首次使用时自动下载。还支持通过 MCP 集成外部工具，并提供 BiomniEval1 评测框架。
限制与注意：Biomni 会以完整系统权限执行 LLM 生成的代码，生产环境应在隔离环境（Docker、VM）中运行，避免暴露敏感凭据，敏感场景下应先审查生成代码。复杂任务需调整超时与迭代上限，大数据集需注意内存。具体价格、平台支持与效果等资料未提供。