用途：通过 STRING 数据库 REST API 查询蛋白质-蛋白质相互作用（PPI），覆盖网络检索、功能富集（GO、KEGG、Pfam、InterPro）、互作伙伴发现、PPI 富集检验、网络可视化与同源分析。适用于通路分析、系统生物学、复合物与结构研究等场景；化合物互作应改用 chembl-database-bioactivity，通路中心查询用 kegg-database。
主要能力：get_string_ids 做基因名到 STRING ID 映射；network 获取互作网络（functional 或 physical）；image 生成网络图；interaction_partners 发现伙伴；enrichment 做 Fisher 精确检验加 BH FDR 校正的富集；ppi_enrichment 检验蛋白集是否构成显著模块；homology 计算同源相似度。输出支持 TSV、JSON、PNG/SVG、PSI-MI 等格式。
使用方式：先安装依赖 uv pip install requests pandas。调用基址为 https://string-db.org/api，格式段可替换为 tsv/json/image。建议先用 get_string_ids 映射标识符，再执行后续查询；species 用 NCBI 分类 ID（人 9606、小鼠 10090 等）。置信度阈值 150 探索、400 标准、700 高、900 最高。
限制：无严格速率限制，但每次调用间建议等待约 1 秒；蛋白质组规模分析应改用 https://string-db.org/cgi/download 批量下载。超过 10 个蛋白的网络必须指定 species；富集需 5 个以上蛋白才有意义；大查询应分批 50-100 个。标识符需 URL 编码（%0d 分隔）或 POST 换行分隔。STRING 版本可用 version 端点查询以便复现。
配套资源：主 SKILL.md 加 1 个参考文件，另有 string_api.py 脚本；高级 API 特性、R/Cytoscape 集成、输出格式细节、HTTP 错误码与数据许可见 references/api_advanced.md。