用途:在箱线图、小提琴图、条形图等比较类图表上添加统计显著性标注(括号加星号),使图表的视觉结论与统计检验结果一致,达到可发表标准。
主要能力:给出标准星号记号与p值区间的对应关系(ns为p>0.05,*为p<=0.05,**为p<=0.01,***为p<=0.001,****为p<=0.0001),并提供pvalue_to_asterisk转换函数;区分原始p值与校正后p值的使用场景;给出是否标注及标注哪些比较对的决策框架;提供add_significance_bracket括号绘制函数,以及结合seaborn箱线图、分组条形图的集成示例。
使用方式:先用scipy等完成检验(如mannwhitneyu、ttest_ind、f_oneway),多重比较用statsmodels的multipletests(method='fdr_bh')校正,再在绘图时调用括号函数,按数据范围设置纵向偏移并扩展y轴上限避免裁切。
适用场景:处理组与对照组比较、ANOVA事后检验显著对、多细胞类型表达比较(仅对参考组)等。
限制:PCA、UMAP、热图、火山图、相关性散点图不应标注;每面板标注对通常控制在1至5个;须在图注中说明检验方法与校正方式;资料未提供具体收费、平台或效果信息。