用途：该技能用 3Dmol.js（WebGL 分子查看器）生成自包含 HTML，在浏览器中渲染分子结构、轨迹或振动模式，无需服务器、构建步骤或 Python 运行时即可查看。
主要能力：支持 xyz、pdb、sdf、mol2、cube、cif 等格式；提供 stick、sphere、line、cross、cartoon 等样式与按元素/链/残基着色；可加载多帧轨迹并用 addModelsAsFrames 播放；对带 dx/dy/dz 位移向量的模型用 model.vibrate 生成振动动画；支持 addSurface 分子表面与 addVolumetricData 轨道/电子密度等值面；可添加标签，并可用滑块绑定 interval 控制播放速度。
使用方式：随附 scripts/mol_viewer.py（仅用 Python 3 标准库），需先用文件工具将其读取并保存到工作目录再运行。示例：python3 mol_viewer.py ts_imaginary_mode_000.trj --mode trajectory --title "TS mode" --subtitle "-621.8 cm-1" --out ts_mode.html；静态结构：python3 mol_viewer.py mol.xyz --out mol.html。也可手写 HTML，加载 https://3Dmol.org/build/3Dmol-min.js，用 $3Dmol.createViewer 创建查看器，addModel 加载坐标字符串，setStyle 设样式，zoomTo 后 render。
适用场景：过渡态虚频振动模式动画、反应路径（IRC/NEB）或 MD 轨迹回放、蛋白-配体对接构象展示、Gaussian cube 轨道/密度等值面显示，以及交付单个可在任意浏览器打开的 HTML 文件。
限制：页面从 CDN 加载 3Dmol.js，打开时需联网，严格 CSP 环境可能显示空白；坐标须以字符串（建议 json.dumps 编码）嵌入而非 URL；动画速度用 interval（毫秒）控制，不要用 step；大轨迹（超过 500 帧或 5000 原子）建议抽帧；XYZ 无连接信息时用 stick/sphere 由距离推断键。Jupyter 内联查看可改用 py3Dmol，出版级静态图或重度结构编辑建议用 PyMOL/ChimeraX。