用途：gget 提供命令行与 Python 两种接口，统一访问 20 多个基因组数据库与分析方法，用于基因查询、序列比对、蛋白结构预测、表达分析、疾病与药物关联、癌症基因组等任务。
主要能力：按域划分模块，包括基因参考（ref、search、info、seq，数据来自 Ensembl、UniProt、NCBI）、序列比对（blast、blat、muscle、diamond）、蛋白结构（pdb、alphafold、elm）、表达与相关性（archs4、cellxgene、bgee）、疾病与药物（opentargets、enrichr）、癌症（cbio、cosmic）以及工具（mutate、setup、gpt）。Python 返回 DataFrame 或 dict，CLI 默认 JSON，可用 -csv 输出 CSV；序列输出 FASTA，结构输出 PDB，单细胞返回 AnnData。
使用方式：安装 pip install gget；部分模块需先运行 gget setup alphafold、gget setup cellxgene、gget setup elm 等。Python 中调用 gget.search、gget.info、gget.seq、gget.blast、gget.enrichr 等函数；CLI 可直接执行对应命令。建议在干净虚拟环境中使用。
适用场景：基因发现到功能分析、药物靶点验证、比较基因组学、批量基因信息检索、自定义背景的富集分析、AlphaFold 结构预测与可视化等。
限制：gget 查询远程数据库，批量查询需用 time.sleep() 限速，gget.info() 单次约 1000 个 Ensembl ID；数据库约每两周更新，需保持 gget 更新；AlphaFold 需约 4GB 模型参数并依赖 OpenMM，预测耗时较长；COSMIC 需账号并下载本地数据库；建议固定 release 与 census_version 以保证可复现。批量处理或高级 BLAST 参数可改用 biopython，多数据库限速工作流可改用 bioservices。