SuperAPI AI 工具集

adaptyv-bio

编程与开发

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更新于 10-15 22:39

技能介绍

用途:Adaptyv Bio 是蛋白表达与表征平台,通过 REST API 和 Python SDK 使用。用户提交蛋白序列(抗体、纳米抗体、酶、结合蛋白),获得无细胞表达产物及结合亲和力(KD,生物膜层干涉法 BLI)测量结果,用于计算设计变体的实验验证、ML 引导的定向进化闭环、高通量蛋白表征自动化,以及 ESM、AlphaFold 或对接预测的实验校验。

主要能力:支持 expression(仅表达)与 binding(表达+结合)两类实验;单次实验最多提交 96 条序列;可查询实验类型、提交实验、轮询状态(pending/running/complete/failed)、获取结果(KD、产量、表达与结合是否通过);支持按项目列出实验历史,并可将结果导出为 DataFrame、CSV 或 FASTA。

使用方式:需安装 adaptyvbio、requests、pandas(pip install adaptyvbio requests pandas),在环境变量中设置 ADAPTYV_API_KEY,用 ab.Client(api_key=...) 初始化后调用 submit_experiment、get_experiment_status、get_experiment_results、list_experiments 等方法。序列以 FASTA 或纯字符串提供,binding 实验需指定账户中已注册的 target 名称。

适用场景:计算设计候选序列的批量筛选与排序、多轮定向进化、将实验 KD 数据回馈给贝叶斯优化或设计模型。

限制:无细胞表达(小麦胚芽或大肠杆菌提取物)可能缺少糖基化等真核修饰;序列长度通常需小于 300 aa;结果仅在状态为 complete 后可取;具体价格、周转时间与账户配额资料未提供。