用途：该技能用于以编程方式访问 COSMIC（Catalogue of Somatic Mutations in Cancer）数据库，获取人类癌症体细胞突变及相关基因组数据，适用于癌症研究、精准医学和生物信息学流程集成。
主要能力：可下载核心编码突变（含点突变、插入缺失与基因组注释）、肿瘤基因普查（Cancer Gene Census，约 700+ 个经专家审编的癌症相关基因）、突变特征（SBS/DBS/ID 签名）、结构变异与基因融合、拷贝数与基因表达数据，以及带临床注释的耐药突变数据。支持 GRCh38（推荐）与 GRCh37（旧版）两个参考基因组，路径中的 latest 会获取最新版本，也支持指定版本（如 v102、v101）以保证可复现。文件格式包括 gzip 压缩的 TSV/CSV 与 VCF，VCF 可用 pysam、bcftools 或 GATK 处理。
使用方式：先注册账号——学术用户在 https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/register 免费注册，商业用户需联系 QIAGEN 获取授权。安装依赖：pip install requests pandas。可通过 Python 调用 download_cosmic_file 函数下载文件，或用命令行：python scripts/download_cosmic.py user@email.com --data-type mutations，也支持 --filepath、--assembly 与 -o 参数。下载后用 pandas 读取并按基因、癌种或基因角色过滤，例如按 Gene name 过滤 TP53、按 Role in Cancer 区分 oncogene 与 TSG，或用 pysam 按区域遍历 VCF。可用辅助函数 get_common_file_path 获取常用文件路径。
适用场景：突变注释（VEP、ANNOVAR、SnpEff）、突变特征分析（SigProfiler、deconstructSigs、MuSiCa）、癌症基因组学（cBioPortal、OncoKB、CIViC）及数据科学分析。
限制：下载需身份认证；商业用途须经 QIAGEN 授权；文件可能达数 GB，需充足磁盘空间且下载耗时较长；使用数据时需按资料所引用文献进行引用。其余具体字段、版本或平台信息暂未提供。