用途：针对单一适应症生成结构化研究档案，以“患者人群”为框架，回答患者是谁、存在什么问题、当前如何治疗，以及如何设计临床试验帮助该人群。
主要能力：分五个阶段运行并写入可恢复的 waypoint 文件。阶段1解析适应症身份（临床定义、ICD 编码、别名、父适应症、是否为公认诊断实体）并做 ClinicalTrials.gov 快速扫描；阶段2研究流行病学（诊断标准、患病率与发病率、人口学与风险因素、自然史）；阶段3研究生物学与标准治疗（病理生理、生物标志物、已批准疗法、治疗指南、未满足需求）；阶段4研究监管与试验（FDA/EMA 接受的终点、监管先例、典型试验设计参数、关键试验与显著失败）；阶段5综合，写出 indication_dossier_report.md 与 research_output.json。阶段1结束后会展示解析出的适应症身份并调用 ask_user 确认（Proceed / Revise identity / Stop），其余阶段直接连续运行。
使用方式：输入 indication（必填，如 "sarcopenia"、"idiopathic pulmonary fibrosis"）；可选 additional_context（关注领域、父适应症等）与 workdir（默认 ./do_not_commit/indication-dossier-<slug>/）。依赖 clinical-trials MCP、pubmed MCP、WebSearch/WebFetch 及 Agent 子代理；若 MCP 未连接，会说明并回退到对底层公开源（clinicaltrials.gov、pubmed.ncbi.nlm.nih.gov）的 WebSearch。开始前需阅读 references/00-research-standards.md 并创建 <workdir>/waypoints/。
输出布局：waypoints/ 下含 progress.json、meta.json、epidemiology.json、biology_soc.json、regulatory_trials.json、sources_evaluated.json、research_output.json 与 indication_dossier_report.md；各 waypoint 文件 schema 见 references/waypoint-schemas.md。
限制：阶段5不开启新研究线程，仅允许针对已有 waypoint 字段缺失值的单次定向补全，更广的缺口应标注为 gap。若 workdir 已含 waypoint，会列出已完成阶段并询问从哪一阶段恢复，未经确认不覆盖已有 waypoint。部分适应症不对应 ICD 编码或标准疾病定义（如 immunosenescence、ageing、GLP-1 induced sarcopenia），需明确标注。具体收费、价格与平台信息暂未提供。