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exploratory-data-analysis

数据与分析

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更新于 10-16 05:51

技能介绍

用途:对科学数据文件执行探索性数据分析(EDA),自动识别文件类型并生成 Markdown 报告,帮助在正式分析前了解数据结构、质量与适用分析方法。

主要能力:覆盖 200 多种科学文件格式,分为化学与分子、生物信息与基因组、显微与成像、光谱与分析化学、蛋白质组与代谢组、通用科学数据六大类;提供格式相关元数据提取、数据质量与完整性评估、统计摘要与分布、可视化建议、后续分析建议,并生成报告。

使用方式:用户提供文件路径后,先提取扩展名并在对应参考文件中查找格式信息,再执行分析。可直接运行脚本:python scripts/eda_analyzer.py <filepath> [output.md];也可在对话中按格式自定义分析,例如表格数据用 pandas,序列数据用 Biopython,图像用 tifffile、nd2reader 等。报告模板位于 assets/report_template.md,输出文件名建议为 {original_filename}_eda_report.md。

适用场景:用户要求探索、分析或总结科学数据文件;需要了解数据结构和内容;在分析前需要综合报告;评估数据质量或完整性;询问某文件适合何种分析。

限制:许多格式依赖专用库,缺失时需按提示安装,如 uv pip install biopython;参考文件较大,建议按扩展名检索而非整体加载;超大文件需采样、分块或内存映射;未知扩展名需向用户确认或尝试通用分析。具体支持范围与效果以实际环境和资料为准,其他细节暂未提供。