用途:该技能用于按 BIDS 社区标准组织、描述和处理神经科学与生物医学研究数据集,覆盖影像、电生理与行为数据,便于人和软件理解。
主要能力:支持 11 种模态(MRI、PET、显微镜、EEG、MEG、iEEG、EMG、NIRS、动作捕捉、行为数据、MR 波谱);提供 BIDS 目录结构、文件命名实体、JSON 侧车元数据、事件文件、衍生数据集等规范;可用 PyBIDS 查询索引,用 bids-validator 校验合规性,用 HeuDiConv、dcm2bids、BIDScoin 从 DICOM 转换。
使用方式:安装命令为 uv pip install pybids、uv pip install bids-validator-deno、uv pip install heudiconv、uv pip install dcm2bids、uv pip install nibabel、uv pip install pydicom。用 BIDSLayout 索引数据集并按 subject、task、suffix 等查询;用 bids-validator /path/to/bids_dataset 校验;用 .bidsignore 排除文件;用 dataset_description.json 描述数据集。
适用场景:整理原始数据、查询已有数据集、共享或投稿前校验、DICOM 转 BIDS、编写侧车元数据、创建衍生数据、准备上传 OpenNeuro 或 DANDI。
限制:BIDS 规范版本、实体顺序与后缀以 BIDS Schema 为准;旧版 Node.js 校验器已弃用;具体字段与转换配置需参考官方文档,本资料未提供完整细节。