用途：在编写分子动力学（MD）后处理代码之前，帮助确定应做哪些轨迹分析及其前置条件，适用于氧化物玻璃、液态水等材料或分子体系。
主要能力：根据分析目标（如 rdf、diffusion、coordination）生成分析计划，列出每个目标的方法与状态；汇总去重后的所需数据；给出标准平衡前检查清单；说明 PBC 处理（是否需要 unwrap、最小操作、格式说明）；输出安全关键警告。状态从严重到轻微为 blocked > needs time axis > needs review > ready，严重状态不会被降级。
使用方式：需 Python 3.10+，无外部依赖，支持 Linux、macOS、Windows。需收集系统、目标、轨迹格式（dump、DCD、XYZ、H5MD 等）、是否存速度、是否存应力、是否需要 unwrap、每帧时间步长（fs）。运行示例：python3 skills/simulation-workflow/md-analysis-planner/scripts/md_analysis_planner.py --system "oxide glass" --goals rdf,coordination,bond-angle --trajectory-format dump --unwrap-needed --timestep-fs 10 --json。不加 --json 时打印计划行、Required data 列表、单行 PBC 说明和 Warnings 段（同时镜像到 stderr）。
决策指引：局部结构用 RDF 和配位数；扩散用 MSD，但需 unwrap 并确认扩散区；仅当有速度或可靠有限差分速度时用 VACF/VDOS；仅当有应力/维里和形变历史时用 stress-strain；拟合输运或热力学性质前必须做平衡检查。
限制：该技能只做分析与前置条件规划，不直接解析大型轨迹。缺少速度、应力或时间步长信息时会降级相关分析并报告警告；无效输入（空系统、无目标、非正或非有限时间步长、超出大小上限）会以退出码 2 和 stderr 消息结束。输入上限：系统名 256 字符、最多 64 个目标、每个目标 256 字符、轨迹格式 256 字符。脚本不读写文件，仅 stdin/args 到 stdout，警告镜像到 stderr；不使用 eval、exec、os.system 或动态导入，不启动子进程。未识别目标不拒绝，但标记为 needs review 并给出 unknown goal 警告。验证清单与常见陷阱见 references/md_analysis_checks.md。