用途：为生物信息学分析创建可复现的 Jupyter Notebook 报告，通过 papermill 实现参数化，适用于自动化分析报告场景。
主要能力：用 papermill 以参数执行 Notebook，生成输出报告；在模板中用 parameters 标签定义可配置项；对样本列表批量执行 Notebook；用 jupyter nbconvert 将结果导出为 HTML 或 PDF。
使用方式：调用 pm.execute_notebook('analysis_template.ipynb','output_report.ipynb',parameters={...}) 传入参数；在模板单元格中标注 parameters 标签并给出默认值；对多个样本循环执行；使用命令 jupyter nbconvert --to html report.ipynb，或加 --execute，导出 PDF 需 pandoc 与 LaTeX 支持。
最佳实践：分析代码放代码单元、说明文字放 Markdown；所有可配置值使用参数；记录版本信息与时间戳；提交版本控制前清除输出。
相关技能：reporting/quarto-reports、reporting/rmarkdown-reports、workflows/rnaseq-to-de。