用途：fastp 一体化预处理 FASTQ 读段，单次运行完成接头修剪、质量过滤、去重与报告生成，适用于 Illumina、NovaSeq/NextSeq、RNA-seq 等读段清洗。
主要能力：默认自动检测 Illumina 接头，可手动指定 --adapter_sequence、--adapter_sequence_r2 或 --adapter_fasta，也可 --disable_adapter_trimming；质量过滤支持 --unqualified_percent_limit、-q、-e，可禁用；质量修剪支持 --cut_right、--cut_front、--cut_tail 及对应窗口与均值参数；长度过滤用 -l 与 --length_limit；poly-X 修剪含 --trim_poly_g（NovaSeq/NextSeq 自动启用）、--trim_poly_x、--poly_g_min_len；N 碱基用 -n；去重用 --dedup 与 --dup_calc_accuracy；双端可用 --correction 做重叠碱基校正、--merge 合并重叠读段；UMI 通过 --umi、--umi_loc（index1、index2、read1、read2、per_index、per_read）、--umi_len 处理。
使用方式：单端 fastp -i input.fastq.gz -o output.fastq.gz；双端 fastp -i R1.fastq.gz -I R2.fastq.gz -o R1_clean.fastq.gz -O R2_clean.fastq.gz；自定义报告加 -h sample_report.html -j sample_report.json；线程用 --thread 8；可经 --stdin 从标准输入读取，或 --html /dev/null 跳过报告提速。输出为处理后的 FASTQ 与 HTML/JSON 报告。
适用场景：标准 Illumina、NovaSeq/NextSeq、RNA-seq 的常规清洗流程。
限制：资料未提供安装方式、许可证、性能基准与参数默认值以外的信息；部分功能（如碱基校正）仅限双端。