用途：构建与管理 DIA 谱图库。DIA 库本质是肽段查询参数（母离子 m/z、若干碎片 m/z 及相对强度、归一化 RT、可选 CCS），用于提取和打分共洗脱碎片色谱峰组，而非整张谱图比对。
主要能力：生成实验型 DDA 库（EasyPQP、FragPipe）、色谱图库（EncyclopeDIA、GPF）、预测库（Prosit、AlphaPeptDeep、MS2PIP+DeepLC、UniSpec）及经验校正预测库；进行 RT/CCS/NCE 校准、格式转换（DIA-NN、OpenSWATH、Spectronaut）与库 QC/合并。
使用方式：通过 Koina 服务调用预测模型，例如 from koinapy import Koina; Koina('Prosit_2019_intensity', 'koina.wilhelmlab.org:443')，输入通常为 peptide_sequences、precursor_charges、collision_energies；本地预测可用 ms2pip.predict_batch(psms, model='HCD')；RT 预测用 deeplc.DeepLC().calibrate_preds() 与 .make_preds()。预测 iRT/CCS 为任意模型单位，必须用 iRT/CiRT 锚点肽回归校准（建议 R^2 > 0.95），或经 GPF-DIA 经验校正后再搜索。NCE 需与预测器训练条件匹配，建议扫描候选值选取谱图对比度最大者。OpenSWATH 需用 OpenSwathDecoyGenerator 追加诱饵。合并去重须使用完整五字段键（修饰序列、母离子电荷、碎片类型、碎片序号、碎片电荷）。
适用场景：无 DDA 数据的模式生物、非模式生物或变异库、需要离子淌度（timsTOF/diaPASEF）、单项目最大深度、已有深度分级 DDA、OpenSWATH 库、含修饰/PTM 肽段等。
限制：不负责 DIA 搜索（属 dia-analysis）、采集窗口设计与解复用、DDA 肽段鉴定、PTM 解析设计（属 ptm-analysis）及定量汇总。参考示例测试版本：koinapy 0.0.5+、ms2pip 4.0+、deeplc 3.0+、pandas 2.2+；版本不符时需按实际 API 调整。旧 Prosit 端点已失效，应改用 Koina。