用途：从MeRIP-seq（甲基化RNA免疫沉淀测序）数据中，通过IP样本与input对照的比较，调用m6A修饰峰值，识别m6A修饰位点。
主要能力与工具：
- exomePeak2（推荐）：支持生物学重复的峰值调用。用法为调用exomePeak2()函数，传入bam_ip、bam_input、gff、genome、paired_end等参数，随后用exportResults(result, format = 'BED')导出峰值。
- MACS3替代方案：将input视为对照进行峰值调用，命令为macs3 callpeak -t IP_rep1.bam IP_rep2.bam -c Input_rep1.bam Input_rep2.bam -f BAMPE -g hs -n m6a_peaks --nomodel --extsize 150 -q 0.05。
- MeTPeak：支持GTF注释的峰值调用，调用metpeak()函数，传入IP_BAM、INPUT_BAM、GENE_ANNO_GTF、OUTPUT_DIR参数。
峰值过滤：可按倍数富集与q值过滤，典型阈值为FC > 2、q < 0.05，示例命令为awk '$7 > 2 && $9 < 0.05' peaks.xls > filtered_peaks.bed。
相关技能：merip-preprocessing用于峰值调用前的数据准备；m6a-differential用于比较不同条件下的峰值；chip-seq/peak-calling概念类似。
限制：资料未提供各工具的具体版本要求、运行环境依赖、输入文件格式细节及性能说明，暂未提供。