用途：为差异表达（DE）分析生成标准图件面板，分为诊断图与结果图两类，把图形当作底层统计模型的诊断依据。主要能力包括：离散度图 plotDispEsts(dds)（DESeq2）与 plotBCV(y)（edgeR）；p 值直方图（用 ggplot2 绘制）；基于 VST/rlog 的 PCA 与样本距离热图；MA 图 plotMA(res) 与 plotMD(qlf)；火山图（ggplot2 包装或 EnhancedVolcano）；Top 差异基因热图；单基因 plotCounts。
必要用法要点：先看离散度图与 p 值直方图，再信任结果；PCA 必须先做方差稳定（vst 或 rlog），不可用原始 counts，QC 用 blind=TRUE，结果图用 blind=FALSE；n<30 且文库大小差异超 4 倍时用 rlog，n>30 用 vst。火山图横轴用收缩后 LFC（lfcShrink 的 apeglm），纵轴为未收缩 Wald p 值，坐标轴需注明；标签超过 10 个基因时设 max.overlaps=Inf 或 options(ggrepel.max.overlaps = Inf)，否则默认 10 会静默丢标签。热图看模式用 scale='row'（按基因 z 分数），QC 热图看绝对水平用 scale='none'。选高变基因建议用 matrixStats::rowMads 而非 rowVars。超过 3 个基因集比较用 UpSet 而非 Venn。
限制：资料仅给出参考版本范围（DESeq2 1.42+、edgeR 4.0+、limma 3.58+、ggplot2 3.5+、pheatmap 1.0+、RColorBrewer 1.1+、ggrepel 0.9+、EnhancedVolcano 1.20+、matrixStats 1.2+），使用前需用 packageVersion 核对版本并按实际 API 调整示例；EnhancedVolcano 1.10-1.11 参数名不同。n=3 时结果应视为探索性。其余运行环境、收费与完整安装方式暂未提供。