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数据与分析

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更新于 10-15 21:42

技能介绍

用途:面向计算材料科学的模拟数据分析,解析 LAMMPS 与 Quantum ESPRESSO 输出并计算常见物性,适用于平衡态检查、结构分析、动力学性质与电子结构分析,并可将结果整理为脚本、数据、图表和 results.md。

主要能力:解析 LAMMPS log 文件的热力学表格数据;读取 .lammpstrj 轨迹;计算 MSD 和扩散系数、RDF;解析 Quantum ESPRESSO 的总能量、受力、应力、能带与 DOS;用 matplotlib 绘制能量随时间、RDF、能带图;支持通过 Green-Kubo 计算热导率。

使用方式:Python 分析使用 blackwell-ml conda 环境,例如 conda run -n blackwell-ml python script.py,或 conda activate blackwell-ml;可用包有 numpy、scipy、pandas、matplotlib、pytorch、cupy。QE 能量可用 grep "!" output.out | tail -1 提取。分析结果建议保存到 workspaces/project-name/analysis/ 下的 scripts、data、figures 和 results.md。

适用场景:扩散系数、RDF、MSD、能量、热导率、能带、DOS 等计算材料学常规分析,以及模拟结果的可视化与汇总。

限制:资料未提供具体版本的兼容性、性能、收费或平台信息。实施分析前需明确所测物理量、单位和预期范围,必要时查阅方法资料;结果需用已知体系、文献值和收敛性验证,不应用明显错误的结果。资料仅给出方法示例,未提供完整生产级实现与端到端使用步骤。