用途：为学术研究项目提供标准化结构与重构流程，使项目在立项之初或经整理后适合 Alex 辅助的研究全流程。
主要能力：给出推荐目录结构（.github/、docs/、data/raw 与 processed、analysis/scripts、outputs、notebooks、writing/drafts、figures、submissions、references/ 等）；提供 RESEARCH-PLAN.md、METHODOLOGY.md、LITERATURE-MATRIX.md、DECISION-LOG.md、DATA-DICTIONARY.md、copilot-instructions.md 等模板；提供已有项目的审计清单与六阶段重构流程（清单盘点、脚手架创建、文件迁移、追溯性文档、链接更新、验证）；附带命名约定、版本控制建议与常见问题排解；另含临床研究扩展，如 IRB 协议章节、入排标准、外部 IRB 比较、证据置信度与多语言知情同意文件命名。
使用方式：新项目可用 mkdir -p 创建目录并用 touch 建立必要文件；已有项目按 checklist 审计，用 git mv 迁移文件以保留历史，再补写文档。示例命令：mkdir -p .github/prompts docs data/{raw,processed} analysis/{scripts,outputs} writing/{drafts,figures} references/notes；git mv old-data.csv data/raw/。
适用场景：学术研究、临床研究及需要规范数据与文献管理的项目搭建或整理。
限制：不修改代码内容；具体软件版本、依赖、定价与效果资料中暂未提供；引用其他技能时其细节需另行查阅。