用途：brain qa 用于对 Alex 认知架构做语义、逻辑、代码与架构验证，不只统计文件数量，还检查含义是否一致。它由脚本与人工语义审查两部分组成，脚本负责结构，技能负责意义。
主要能力：提供两个脚本，brain-qa.ps1 面向 Master Alex，含 31 个完整阶段；brain-qa-heir.ps1 面向 Heir 部署，含 23 个相关阶段，同步时会被重命名为 brain-qa.ps1。阶段覆盖突触目标、继承字段、技能索引覆盖、触发词语义、Master-Heir 技能同步、突触 schema、文件同步、目录准确性、令牌预算、样板描述、Heir 重置、指令同步、代理结构、配置、YAML frontmatter、内部技能隐藏、交接、ApplyTo 模式、LLM 友好内容、emoji 语义、情景档案、资产、Issue/PR 模板、根文件完整性、文档新鲜度、M365 与 Codespaces Heir、全局知识同步、肌肉完整性、ROADMAP 版本对齐等。
使用方式：在 Master 上下文可运行 .github/muscles/brain-qa.ps1 执行完整审计，或用 -Mode quick、sync、schema、llm 等模式，也可用 -Phase 指定阶段，-Fix 自动修复同步问题。Heir 上下文不支持 -Mode sync。
适用场景：发布前检查、增改技能后验证突触逻辑、批量突触更新后检查语义、怀疑触发冲突、验证 Master-Heir 一致性、检查 LLM 友好格式、文档重构后确认含义未漂移、代码与文档不一致时审查。
限制：脚本只能捕获结构问题，语义、逻辑、代码行为与架构一致性需人工按清单审查；部分阶段为 Master 专属；已知缺口包括脑 HTML 硬编码计数漂移与运动皮层映射等未来阶段。具体收费、平台与效果资料未提供。