primekg

PrimeKG 是整合 20 多个主要数据库与高质量科学文献的精准医学知识图谱，包含超过 10 万个节点、约 400 万条边和 29 种关系类型，覆盖药物-靶点、疾病-基因、表型-疾病等关联。用途包括基于知识的药物发现、药物重定位、表型分析、多尺度生物学研究和网络药理学。主要能力：搜索基因、蛋白质、药物、疾病、表型等节点；检索直接邻居及关联实体和临床证据；分析疾病局部背景（相关基因、药物、表型）；识别药物-疾病路径以寻找重定位机会。使用方式：通过 scripts/query_primekg.py 提供 search_nodes、get_neighbors、get_disease_context 等函数进行程序化查询。数据存于 CSV 文件，路径资料中给出两个示例，请以实际安装环境为准。建议先用 search_nodes 获取正确 ID，再用 get_disease_context 获得疾病概览，并在 get_neighbors 中按 relation_type 过滤关系。该技能可与 OpenTargets、Semantic Scholar 等资源结合使用。限制：资料未说明收费、平台支持、运行依赖或数据更新机制。