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adaptyv

编程与开发

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更新于 10-15 21:39

技能介绍

用途:通过 Adaptyv Bio Foundry API 或 Python SDK 将蛋白质氨基酸序列提交到云端自动化实验室,运行结合、热稳定性、表达、荧光等实验并获取结果,官方称约 21 天交付。

主要能力:支持 affinity(bli/spr,测 KD、kon、koff)、screening(bli/spr,测是否结合)、thermostability(Tm)、expression(表达产量)、fluorescence(荧光强度)等实验类型;提供目标浏览、成本估算、实验创建与提交、结果获取;列表接口支持分页、搜索、排序及 s-expression 过滤;支持 Webhook 状态通知;Token 支持基于 Biscuit 的权限衰减与撤销。

使用方式:Base URL 为 https://foundry-api-public.adaptyvbio.com/api/v1,认证使用 Authorization: Bearer 令牌,令牌从 foundry.adaptyvbio.com 侧边栏获取。代码中应从环境变量 ADAPTYV_API_KEY 或 .env 读取,切勿硬编码。SDK 版本 0.1.0(beta)尚未上 PyPI,需从 GitHub 安装:uv pip install "git+https://github.com/adaptyvbio/adaptyv-sdk.git"。可用 @lab.experiment 装饰器或 FoundryClient 客户端模式。实验生命周期为 Draft → WaitingForConfirmation → QuoteSent → WaitingForMaterials → InQueue → InProduction → DataAnalysis → InReview → Done,另有 Canceled。序列仅可在 Draft 状态添加,支持简单格式、富格式(含 control、metadata)及冒号分隔的多链格式,有效氨基酸为 A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Y。

适用场景:需要将蛋白质序列外包给自动化实验室进行湿实验验证的科研与工程流程,包括批量筛选、自动化流水线(skip_draft、auto_accept_quote)等。

限制:除 GET /openapi.json 外所有请求均需认证;令牌不得提交到源码管理;实验提交后需等待实验室流程;具体价格、交付时间等以官方文档为准,本资料未提供完整价格表。