用途：作为 DeepOrbit 的 Vault Custodian，让整个知识库保持整洁有序。它会分析根目录杂乱、分类混乱、概念重叠、失效链接、孤立笔记和缺失元数据等问题，先给出重组方案，经用户批准后再执行。
主要能力：
- 根目录卫生：根目录只允许模板定义的编号文件夹、系统目录（.gemini、.agent、.obsidian、.git 等）和配置文件；其余 Markdown 建议移入 00_Inbox/ 或对应编号文件夹，未知文件夹建议合并或归档，媒体移入 99_System/ 或项目文件夹，临时文件建议删除。
- 结构扫描：运行 python3 scripts/analyze_vault.py 获取 JSON 报告，识别 empty_folders、orphan_files、missing_metadata、ghost_links。
- 分类审查：依据 99_System/Templates/Vault_Tree_Template.md 检查 40_Wiki、30_Research 等，执行扁平层级与语义优先规则，合并重叠文件夹。
- 孤立笔记聚类：对 00_Inbox 之外的孤立文件用 deeporbit --vault . rag "<内容>" 找相似位置；00_Inbox 内容不自动 RAG、不自动移动，留给用户手动分诊。
- 生命周期分诊：deeporbit --vault . status 查看 active/paused/done/archived，done 项建议 /do:archive。
使用方式：先读模板，再跑分析脚本，生成提案（根目录清理、分类合并、孤立笔记、结构健康），用户可全部批准、部分批准或反馈，批准后才执行移动、合并、用 python scripts/update_metadata.py <file-path> --set area=XXX --set tags=XXX 更新元数据、清理空文件夹。
限制：未经用户明确批准不得做结构变更；deeporbit.json 中 readonly.directories 的只读区（如 weread-vault 导出）不得移动或合并；作者信息只写在 frontmatter，不添加可见徽章；创建或修改 Markdown 用 do.obsidian-open 打开，失败不致命。交互语言由 deeporbit.json 决定，Obsidian 文件夹路径始终为英文。