用途：初始化或安全升级 DeepOrbit Obsidian 仓库，适合用户要求搭建 DeepOrbit、创建仓库文件夹或迁移旧版本地化文件夹时使用。
主要能力：运行确定性初始化器，创建缺失文件夹（含 15_Writings），保留已有笔记，仅在安全时合并旧版本地化文件夹，遇到冲突文件只报告不覆盖。初始化会把工作流技能写入 99_System/DeepOrbit/skills/，生成 99_System/DeepOrbit/skills-index.json，补齐系统模板、提示词与 Bases，刷新导师指南，并把精选运行时包复制到 99_System/DeepOrbit/repo/。该包包含技能、命令、提示词、钩子、CLI 源码、MCP、文档与清单，排除 .git、虚拟环境、缓存、构建产物、node_modules 和生成的 agent 安装目录。
使用方式：
deeporbit --vault "<vault-path>" init --source "<deeporbit-repo-path>"
若 deeporbit 可执行文件不可用，改用：
PYTHONPATH=<repo>/src python -m deeporbit --vault "<vault-path>" init --source "<repo>"
命令是幂等的。外部工作区只需安装全局 do.link 连接器；初始化后仓库自身携带路由所需的工作流目录。
初始化后：读取 JSON 结果；若 conflicts 非空，展示每个路径并询问用户如何合并，不要删除任一文件；运行 deeporbit --vault "<vault-path>" doctor；说明哪些可选能力可用。缺少 Obsidian CLI、ChromaDB、Tasks、Dataview 或 Calendar 不应视为初始化失败。
限制：资料未提供收费、价格、平台支持范围等更多信息。