用途：gtars 是面向基因组区间数据的高性能 Rust 工具包，提供 Python 绑定和命令行工具，适合处理 BED 格式区间、重叠检测、覆盖度分析与基因组机器学习预处理。
主要能力：包含重叠检测与 IGD 索引（用于寻找调控元件重叠、变异注释、比较 ChIP-seq 峰等）；uniwig 模块生成 WIG/BigWig 覆盖度轨迹；基因组分词（TreeTokenizer）将区间转为离散 token，服务深度学习模型；RefgetStore 按 GA4GH refget 协议管理参考序列与摘要；片段处理支持按细胞条形码拆分单细胞数据；片段打分用于评估富集与质量。支持 BED、WIG/BigWig、FASTA、Fragment TSV 等格式，具备多线程、内存映射与 NumPy 零拷贝集成。
使用方式：Python 安装用 uv pip install gtars；CLI 需 Rust/Cargo，用 cargo install gtars-cli --features "uniwig overlaprs igd bbcache scoring fragsplit" 安装。典型流程如构建 IGD 索引后查询重叠、用 gtars uniwig generate 生成覆盖度、用 TreeTokenizer 分词，以及用 gtars fragsplit cluster-split 按簇拆分片段。可用 gtars.set_log_level("DEBUG") 或 gtars --verbose 开启调试日志。
适用场景：ATAC-seq/ChIP-seq/RNA-seq 覆盖度可视化、变异与峰注释、单细胞 ATAC 片段分析、基因组机器学习预处理，以及作为 geniml 包的底层依赖。
限制：资料未提供具体性能基准、支持的物种范围、版本兼容细节与错误处理边界，部分表格内容缺失，暂未提供更多限制说明。