SuperAPI AI 工具集

biomni

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更新于 10-16 03:38

技能介绍

用途:Biomni 面向生物医学研究的多步骤推理与数据分析任务,覆盖 CRISPR 筛选、单细胞 RNA-seq、药物发现、GWAS 分析、临床基因组学与实验方案设计等场景。

主要能力:自主任务分解与规划;动态生成并执行分析代码;检索约 11GB 集成的生物医学数据库与文献(如 Ensembl、UniProt、PDB、ClinVar、OMIM、KEGG、Reactome 等);提供基因组学、蛋白质组学、药物发现与临床任务的统一接口。

使用方式:通过 uv pip install biomni --upgrade 安装,配置 LLM 的 API 密钥(如 export ANTHROPIC_API_KEY="your-key-here",可选 OpenAI、Azure、Google、Groq、AWS Bedrock)。核心接口为 A1 类:agent = A1(path='./data', llm='claude-sonnet-4-20250514'),再用 agent.go("研究问题") 执行任务,并用 agent.save_conversation_history("report.pdf") 保存结果。可通过 biomni.config.default_config 调整 llm、timeout_seconds、max_iterations 等参数。支持通过 MCP 服务器扩展外部工具,并提供 BiomniEval1 评估框架。

适用场景:需要多步生物推理、组学数据处理、变异解读、化合物 ADMET 预测或实验设计的科研工作流。

限制与注意:Biomni 会以完全系统权限执行 LLM 生成的代码,生产环境应在隔离环境(Docker、VM)中运行,避免暴露敏感凭据,并在敏感场景下先审查生成的代码。数据湖首次使用时自动下载,复杂任务需合理设置超时与迭代上限。具体收费、价格与平台信息暂未提供。