用途:Adaptyv 是云端实验室平台,面向需要实验验证的蛋白质设计工作流,尤其是高通量、AI 驱动的蛋白质设计场景。提交蛋白质序列后可获得实验测试与验证结果。
主要能力:支持多种实验类型,包括结合实验(用生物膜干涉法测试蛋白质与靶标相互作用)、表达测试、热稳定性表征和酶活性评估。
使用方式:平台需 API 认证,当前处于 alpha/beta 阶段,需联系 support@adaptyvbio.com 申请访问并获取令牌。通过环境变量配置:export ADAPTYV_API_KEY="your_api_key_here",或写入 .env 文件。安装依赖:uv pip install requests python-dotenv。提交实验时向 base_url 为 https://kq5jp7qj7wdqklhsxmovkzn4l40obksv.lambda-url.eu-central-1.on.aws 的 /experiments 端点发送 POST 请求,携带 Authorization: Bearer 令牌和 JSON 正文,正文包含 sequences、experiment_type(如 binding)及可选 webhook_url,响应返回 experiment_id。
序列优化:提交前可优化序列以改善表达与稳定性,常见问题包括游离半胱氨酸形成非目标二硫键、过度疏水区域导致聚集、溶解度预测差。推荐工具包括 NetSolP/SoluProt 做溶解度初筛、SolubleMPNN 重设计提升溶解度、ESM 做序列似然评分、ipTM 评估界面稳定性、pSAE 量化疏水暴露。
限制:平台处于 alpha/beta,功能可能变化;并非所有功能均可通过 API 使用;结果通常约 21 天交付;需联系邮箱申请访问。更多端点、请求/响应格式与示例请参见资料中的 reference 文档。