用途：查询 gnomAD（Genome Aggregation Database）这一公开人类遗传变异集合，用于变异频率查找、致病性评估、功能缺失不耐受分析、人群分层频率比较和基因约束分析。gnomAD v4 包含 730,947 例外显子组和 76,215 例基因组数据。
主要能力：通过 GraphQL API（POST https://gnomad.broadinstitute.org/api）按基因或特定变异查询；获取基因组与外显子组的 AF、AC、AN、ac_hom 及分人群频率；获取基因约束评分（pLI、LOEUF、oe_lof、mis_z、syn_z 等）；获取 LoF 注释（lof、lof_flags、lof_filter）与 in silico 预测因子。数据集包括 gnomad_r4（v4 外显子，GRCh38）、gnomad_r4_genomes、gnomad_r3、gnomad_r2_1（GRCh37）。
使用方式：用 Python requests 向 API 端点发送 GraphQL 查询，示例查询按基因获取变异、按 variant_id（如 17-43094692-G-A）获取变异详情、获取基因约束评分、提取分人群频率。人群 ID 包括 afr、ami、amr、asj、eas、fin、mid、nfe、sas。约束评分解读：pLI >0.9 高度不耐受；LOEUF <0.35 受约束；mis_z >3.09 受约束；LOEUF 比 pLI 更受推荐。
适用场景：变异致病性评估（ACMG BA1/BS1/PM2）、罕见病基因优先级排序、与 ClinVar 交叉引用。
限制：需处理空响应，gnomAD 中缺失有信息量但不具决定性；需区分外显子与基因组数据；GraphQL 查询需限速并加重试；默认使用 gnomad_r4，仅 GRCh37 兼容时用 v2。支持文件 graphql_queries.md 与 variant_interpretation.md 提供查询模板与 ACMG 阈值。本技能改编自 K-Dense-AI/claude-scientific-skills（CC0-1.0），原作者 Kuan-lin Huang。