用途：gget 提供统一的命令行与 Python 接口，访问 20 多个基因组数据库，用于基因检索、序列分析、结构预测、表达与疾病关联查询等生物信息学任务。
主要能力：参考与基因信息模块包括 ref（下载 Ensembl 参考基因组）、search（按名称/描述查找基因）、info（基因/转录本元数据，整合 Ensembl、UniProt、NCBI）、seq（核苷酸/蛋白序列）。序列分析模块包括 blast（NCBI BLAST）、blat（UCSC BLAT 基因组定位）、muscle（多序列比对）、diamond（快速本地比对）。结构与蛋白模块包括 pdb（查询 PDB）、alphafold（预测三维结构，需 setup）、elm（真核线性基序，需 setup）。表达与疾病模块包括 archs4（相关基因/组织表达）、cellxgene（单细胞 RNA-seq，需 setup）、enrichr（GO/通路富集）、bgee（跨物种同源与表达）、opentargets（疾病与药物关联）、cbio（癌症基因组）、cosmic（体细胞突变，需账户）。其他模块有 mutate（生成突变序列）和 setup（安装模块依赖）。
使用方式：安装命令为 uv pip install --upgrade gget；部分模块需先运行 gget setup alphafold|cellxgene|elm|gpt。CLI 用法为 gget <module> [arguments]，例如 gget search -s human BRCA1、gget info ENSG00000012048、gget seq ENSG00000012048 -t。Python 用法为 import gget 后调用 gget.module(arguments)，例如 gget.search(["BRCA1"], species="homo_sapiens")。常用标志：-o 保存到文件、-csv 输出 CSV、-q 静默。
适用场景：基因发现到序列分析流程、基因列表富集分析、批量 BLAST/比对处理、单细胞数据查询、比较基因组学等。
限制与注意事项：部分模块需额外 setup 或账户（如 cosmic）；单细胞基因符号大小写敏感；建议用 --limit 控制结果规模，用 -o 保存结果以便复现；gget info 一次处理约 1000 个 Ensembl ID；gget muscle 大数据集可用 -s5；AlphaFold 多聚体可用 -mr 20 与 -r；数据库结构会变化，建议定期升级。具体收费、价格与平台支持暂未提供。