用途：该技能用于自动化 Galaxy 工作流，基于 BioBlend（Python Galaxy API 库）和 Planemo（Galaxy 工作流测试与执行工具），适用于任何 Galaxy 自动化项目，而非特定项目。
主要能力：通过 API 自动执行 Galaxy 工作流；构建批处理系统；用 BioBlend 与 Galaxy 交互；用 Planemo 测试工作流；以编程方式管理 Galaxy 历史、数据集与集合；轮询工作流调用状态；实现错误处理与重试逻辑；创建自动化流水线；将 Galaxy 集成到更大的生物信息学流程中。
参考文件：bioblend-reference.md（连接、历史管理、工作流调用、状态检查、错误处理、rerun API、数据集与集合操作）；planemo-reference.md（命令结构、job YAML 格式、命令生成、输出解析、curl/认证模式）；automation-patterns.md（线程安全、批处理、断点续跑、调试）。
安全与用法要点：API Key 存于环境变量（如 GALAXY_API_KEY），日志中需掩码；shell 命令中的路径要加引号；并发上传需限制（通常 3-5）；调用工作流前须等待数据集状态为 ok；历史名称应唯一；os.system() 退出码需用 return_code >> 8 还原；调用 ID 应立即保存到文件。
关键限制：管理员 API Key 可见所有用户数据，get_invocations() 无过滤会返回全部用户的调用，禁止基于宽泛查询取消/删除/修改调用，只能使用自己工具输出中的具体调用 ID；取消的调用不可恢复。Planemo 返回码非 0 表示工作流未启动，而调用状态 failed 表示已启动但 Galaxy 作业失败，两者不可混淆。
Galaxy MCP：使用 mcp__Galaxy__* 工具时需在会话开始时连接，MCP 无法直接读取 shell 环境变量，需先用 Bash 解析（如 echo "$GXYVGP"、$TESTKEY、$MAINKEY），再传入 connect(url, api_key)。测试与工作流运行应使用 $TESTKEY，$MAINKEY 仅用于管理任务。
浏览器自动化：browser-use 0.12+ 需使用 browser_use.llm.anthropic.chat.ChatAnthropic 并显式传入 api_key；通过 CDP 连接（BrowserSession(cdp_url="http://localhost:9222")），Chrome 以 chrome --remote-debugging-port=9222 启动；cookie 注入自动登录不可靠，应让用户手动登录。
相关技能：galaxy-tool-wrapping、galaxy-workflow-development、vgp-pipeline。资源：BioBlend、Planemo、Galaxy API 与 Galaxy Training 官方文档。