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exploratory-data-analysis

数据与分析

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更新于 10-16 08:35

技能介绍

用途:对科学数据文件执行探索性数据分析(EDA),自动识别文件类型并进行格式相关分析,输出 Markdown 报告,便于为后续分析做准备。适合用户提供科学数据文件路径、要求“探索/分析/总结”数据、了解数据结构与内容、评估数据质量或判断适合的分析方法时使用。

主要能力:覆盖六大类 200 多种格式——化学与分子、生物信息与基因组、显微与成像、光谱与分析化学、蛋白与代谢组学、通用科学数据。支持自动检测文件类型、提取格式相关元数据、数据质量与完整性评估、统计摘要与分布、可视化建议、后续分析建议,并生成 Markdown 报告。

使用方式:先根据扩展名在对应 references 参考文件中查找格式说明,再用脚本或对话内自定义分析。脚本用法:python scripts/eda_analyzer.py <filepath> [output.md]。也可按数据类型在对话中分析:表格数据用 pandas,序列数据统计条数与长度分布,图像检查维度与位深,数组检查形状与类型。报告按 assets/report_template.md 生成,命名为 {original_filename}_eda_report.md。

适用场景:分析前的数据集摸底、数据质量与完整性检查、格式与结构理解、为下游分析选型提供依据。

限制:许多格式需专用 Python 库(如 biopython、rdkit、nd2reader 等),缺失时脚本会报导入错误并提示安装,例如 uv pip install biopython;大文件需采样或分块处理;参考文件较大,应按扩展名检索而非整体加载;未知格式需向用户确认。多文件分析、批量与整合策略的具体实现资料中未提供完整细节。