用途：COBRApy 是约束性重建与分析（COBRA）的 Python 库，用于系统生物学研究中的基因组尺度代谢模型计算模拟、代谢工程分析与表型预测。
主要能力：模型管理（加载内置模型如 textbook、ecoli、salmonella，读写 SBML/JSON/YAML）；访问反应、代谢物、基因等组件；通量平衡分析（FBA，含 pfba、geometric_fba）；通量变异分析（FVA，支持 loopless 与指定反应列表）；单/双基因和反应敲除分析（双删除支持多进程）；培养基与最小培养基计算；通量采样（optgp、achr）；生产包络（表型相平面）；gapfilling 补反应；以及从零构建模型。
使用方式：通过 Python 导入，例如 from cobra.io import load_model 加载模型，model.optimize() 运行 FBA，from cobra.flux_analysis import flux_variability_analysis 进行 FVA，from cobra.sampling import sample 采样。可用 with model: 上下文管理器做临时修改并自动还原。模型交换与长期存储推荐 SBML 格式。
适用场景：代谢网络模拟、必需基因筛选、培养基优化、通量不确定性分析等。
限制：资料未提供具体收费、价格或许可信息；求解器可选 GLPK、CPLEX、Gurobi，性能与可用性取决于求解器。不可行/无界解需检查约束与边界。官方文档：https://cobrapy.readthedocs.io/en/latest/