用途：规划多章节（3-7 章）科学研究数据分析，产出带伪代码的 markdown 分析文档，并生成面向不同读者的说明文档。适用于需要统计、数学、编程专家视角的 RNA-seq、蛋白质组学、成像等分析规划；不用于代码实现、文献综述或单次无章节结构的分析。
主要能力：七阶段工作流，含初始化、鸟瞰规划、子章节规划、结构审查、计划审查、文档生成、统计事实核查、受众文档生成，预计 61-81 分钟（3 章）。产出 research-structure.md、chapter{N}-notebook-plans.md、analysis-strategy-overview.md、researcher-plan.md 及 .research-architecture/ 下的移交文档。设计中生物学无关：代理通过提问获取上下文，不注入生物学解释。
使用方式：作为编排者协调专家（使用 Task 工具并行执行独立工作，Skill 工具加载领域知识）；每次响应以“[Phase N/7 - {phase_name}]”锚定状态，阶段开始前读取 session-state.json。会话目录优先 {output_directory}/.scientific-analysis-session/，回退 /tmp/scientific-analysis-architect-session-{YYYYMMDD}-{HHMMSS}-{PID}/。设有用户审批门（结构审查后、计划审查后）和访谈式统计核查。
适用场景：多章节科研分析规划，需要专家咨询或伪代码文档。
限制：不做实际代码实现；不设计统计方法或算法；专家不可用时停止并告知用户；费率、价格、平台、具体模型版本等暂未提供。