用途:该技能面向固定骨架(fixed-backbone)蛋白质序列设计,适用于任务要求根据给定主链结构生成候选序列、并对设计位置或固定残基进行约束的场景。
主要能力:支持围绕 ProteinMPNN 式流程展开的设计工作流,关注输入结构的记录与设计目标的明确,包括链 ID、设计位置、固定残基、tied positions、对称性等设计约束。
使用方式:先记录输入结构、链 ID、设计位置、固定残基、tied positions、对称性与设计目标;在运行前确认本地或远程执行路径;保存 PDB/mmCIF 输入、设计掩码、命令、随机种子、模型版本、FASTA 输出与评分表;随后按约束条件、多样性、motif、结构预测、保守性与试验可行性筛选设计。
适用场景:适合需要生成、筛选候选蛋白序列并保留完整溯源与验证计划的工作,例如在设计阶段整合结构预测和后续实验验证前,先做候选序列初筛。
限制:资料未提供具体安装命令、模型版本细节、收费与价格信息。生成序列应被视为候选,需要结构验证和实验验证,不能直接视为已验证结果。资料中未提供其他平台支持或扩展功能说明。