OpenFold3 是一个用于 OpenFold 系列结构预测或对比的技能。它适用于需要开放蛋白质或复合物预测、环境搭建、模型对比等场景。
主要能力与工作流：
- 输入规范化：整理 FASTA、链信息、模板、MSA、配体或伴侣、随机种子以及预期输出格式。
- 运行前验证：检查模型代码、检查点、数据库与 GPU 运行路径，确保环境就绪后再执行。
- 产物保存：记录输入清单、环境锁定文件、运行命令、日志、结构输出、置信度文件以及运行时元数据，便于追溯与复现。
- 结果对比：当预测结果会影响决策时，与 AlphaFold 风格、ESMFold 风格、PDB 或文献证据进行比对。
- 可复现性报告：指出缺失数据库、不可用权重、模板失败或特定运行路径的近似处理等复现性缺口。
使用方式：按照上述工作流逐步执行，先规范化输入并验证环境，再运行预测，最后保存全部产物并进行必要对比。该技能明确要求，不得在缺少版本与输入来源的情况下呈现 OpenFold 系列输出。
适用场景：开放蛋白质或复合物结构预测、OpenFold 系列模型对比、预测环境搭建与调试、需要评估预测可靠性与可复现性的研究任务。
限制：资料未提供具体支持平台、收费方式、价格、性能指标或效果数据，暂未提供。