用途:在需要快速获得蛋白质折叠假设时使用,例如无需多序列比对(MSA)的折叠、序列初筛和变体结构筛查,通常作为更重结构预测前的预判手段。
主要能力与流程:
- 将序列规范化为 FASTA,并记录标识符、突变、截断、结构域及寡聚假设。
- 运行前先确认本地或端点路由是否可用。
- 保存 FASTA、模型版本、命令或请求体、预测得到的 PDB/mmCIF、pLDDT/置信度输出以及日志。
- 标记低置信区域、缺失的多聚体、无序区、膜区,以及超出所选路由限制的序列长度。
- 当输出会影响研究决策时,使用 RDKit、3Dmol、PDB 预览及有来源支持的比较。
限制与注意:ESMFold 风格的预测应仅用于初筛,除非有独立检查支持结构结论,否则不应将其视为确定的结构主张。资料中未提供具体安装命令、许可与收费信息。