AlphaFold2 技能
本技能用于蛋白质结构预测，或围绕 AlphaFold2 风格输出进行一致性核查。
工作流
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捕获生物学问题、序列标识、FASTA 输入、寡聚状态、物种，以及预期辅因子或互作对象。
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运行前核验执行路径：本地安装、托管端点、Modal/SSH 作业，或已记录的公开来源。不要假设权重、数据库或 GPU 已存在。
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将输入、命令或端点负载、模型设置、stdout/stderr 以及原始输出保存到当前 Feynman 工件文件夹下。
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报告 pLDDT、PAE、排序置信度、链覆盖度、截断、模板/MSA 来源，以及任何不应信任的残基或界面。
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当结论依赖新颖性、结构域运动、界面几何或突变影响时，与已知结构或 AlphaFold DB 记录进行比较。
输出应包含 FASTA、预测 PDB/mmCIF、可用时的置信度文件、简短方法说明，以及 .provenance.md 附属文件。
适用场景
- 研究任务中需要单体或多聚体结构预测。
- 需要对 AlphaFold2 风格输出进行一致性核查。
- 涉及 MSA（多序列比对）或模板比对的研究工作。
限制与注意事项
- 运行前必须核验执行路径，不得默认已具备权重、数据库或 GPU 资源。
- 报告时需明确不应信任的残基或界面。
- 结论依赖新颖性、结构域运动、界面几何或突变影响时，需与已知结构或 AlphaFold DB 记录进行比较。
- 其他功能、收费、价格、平台、效果或使用步骤暂未提供。