SuperAPI AI 工具集

cc-study-design

写作与研究

查看项目

更新于 10-15 20:08

技能介绍

用途:在设计或审计 Cancer Cell(Cell Press)研究的实验方案时使用,确保机制在多个独立、互补的系统中得到验证,覆盖体外、体内与人类肿瘤锚点。

触发场景:机制仅依赖单一系统(如仅细胞系);审稿人会问“体内是否成立”“患者中是否成立”;对照、重复或样本量逻辑不清;规划小鼠、PDX 或类器官实验时对严谨性要素不确定。

主要能力:提供正交验证阶梯,包括体外(多株已认证细胞系、原代细胞、共培养、生化)、功能遗传学(CRISPR KO/KI、shRNA/siRNA 加回补、点突变、degron)、体内(GEMM、同基因、异种移植、PDX、原位、转移模型)、3D/离体(肿瘤类器官、患者来源类器官、切片培养、球状体)及人类(患者肿瘤样本、TMA、scRNA-seq、TCGA 等公共队列、结局数据)。通常需覆盖体外 + 体内 + 人类锚点,并尽早确定哪些层承担因果主张、哪些提供佐证。

对照要点:遗传扰动需含回补/加回,用至少 2 个独立 sgRNA 或 shRNA(或排除脱靶),匹配非靶向/乱序对照;药理学需溶剂对照、剂量反应、靶向遗传表型模拟,尽可能设耐药突变或类似物;体内需同型/溶剂对照、GEMM 的同窝或共笼对照,预先定义肿瘤体积与终点;抗体/染色需同型、KO/KD 验证、流式单染补偿。

重复与严谨性:生物学重复指独立生物单位(不同小鼠、独立细胞传代/培养、不同患者),用于定义 n;技术重复(复孔、重复测量)只降低测量噪声,不能增加 n,须分别报告,不得用技术重复虚增 n。动物实验需说明样本量依据(效应量与方差来源,可非正式)、随机分组(如肿瘤达设定体积时随机,而非按笼便利)、盲法评估结局(肿瘤测量、组织学评分、影像定量),并预先定义人道终点与排除标准,报告全部动物/样本及排除情况。

人类样本设计:定义队列、入排标准、样本与结局的关联方式;对生存/关联分析做功效估计并预先指定主要比较;注明 IRB/知情同意(可转向 cc-ethics-registration)。

输出格式包含:因果主张层、计划的正交系统、每种扰动的对照、重复(生物学 n 与技术处理)、动物严谨性、人类锚点、提交前需补齐的缺口,以及下一步(cc-reporting-standards 或 cc-statistics)。

限制:资料未提供具体收费、价格、平台或安装方式。