protein-structure-prediction

用途：根据氨基酸序列预测蛋白质三维结构，返回 PDB 坐标文件或结构指标（pLDDT）。适用场景包括：已有蛋白序列需要三维坐标；检查设计序列能否折叠成稳定结构；为对接模拟准备受体。主要能力：折叠生成原子坐标（PDB 格式）；按残基返回 pLDDT 置信度评分；可选生成结构静态视图。使用方式：输入氨基酸序列（FASTA 字符串），将序列发送至 ESMFold API 或本地推理，保存 .pdb 文件并返回置信度指标。示例命令：python3 Skills/Drug_Discovery/Protein_Structure/esmfold_client.py --sequence "MKTIIALSYIFCLVFDYDY" --output structure.pdb。允许工具为 read_file 与 run_shell_command。限制：资料未提供具体安装步骤、依赖环境、API 密钥配置、收费与价格信息；AlphaFold3 标注为 mock，实际可用性暂未提供；运行时间与输出精度等细节暂未提供。