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数据与分析

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更新于 10-15 20:06

技能介绍

用途:从非结构化科学及领域文本中抽取结构化信息,包括实体、关系、事件和条款。

主要能力与数据集:ChemProt(bigbio/chemprot)用于化学-蛋白交互抽取,含CPR:3–CPR:9共10种关系类型;CUAD(atticus-project/cuad)来自510份法律合同,含41种条款类型,采用CC-BY许可;JNLPBA用于生物医学命名实体识别(蛋白、DNA、RNA、细胞系、细胞类型);SciERC用于AI论文摘要的科学实体与关系抽取。

抽取类型:化学-蛋白交互(底物、抑制剂、激动剂、拮抗剂、激活剂);法律条款(终止、知识产权、竞业禁止、赔偿、责任限制);基因-疾病关联(因果、生物标志物、治疗靶点);药物-药物交互(协同、拮抗、药代动力学)。

流程:先定义目标实体类型、关系类型与属性模式;然后做分句、分词、缩写扩展等预处理;再进行命名实体识别(NER)与实体对关系抽取(RE);随后将实体归一化映射到标准本体(MeSH、ChEBI、UniProt);最后输出为结构化JSON、RDF三元组或知识图谱。

规则与限制:需为每个实体/关系报告抽取置信度分数,提供指回源文本的跨度偏移以便追溯,将实体归一化为标准标识符(如CAS、UniProt ID),并处理嵌套实体与重叠关系;在可能时对抽取事实与已知数据库进行校验。资料未提供具体安装命令、收费、价格或平台信息。