quantitative-proteomics

用途：在定量蛋白质组学研究中提供实验设计与统计分析决策支持，覆盖定量策略选择、缺失值评估与填补、归一化、差异表达解读和质控要点。主要能力：按发现或靶向验证目标及样本规模在LFQ、TMT、DIA、PRM/SRM间给出建议；依据缺失模式选择MinProb、QRILC（MNAR）或kNN、MLE、BPCA（MAR）；按生物学变异与批次效应选择中位数中心化、分位数归一化或VSN，TMT需先做上样归一化再作内参缩放；差异表达建议使用limma或DEqMS并同时要求校正p值与|log2FC|阈值。使用方式：向技能描述研究设计、样本数、定量平台与数据特征，即可获得推荐、依据与注意事项；回答以推荐→理由→注意事项组织，通常200-400词，内部决策树不复述。限制：不适用于临床检测方法开发、样本制备主导变异、需同位素标样绝对定量的场景；缺失超50%、单批次结论发表前应咨询人类专家。资料未提供安装命令与URL以外的收费信息。