ehr-data-parsing

用途：该技能提供 Python 管线，用于从 HL7v2（竖线分隔消息）和 FHIR R4（JSON 资源）两大类格式中解析临床数据，适合需要处理电子病历数据的场景。\n\n主要能力：解析 HL7v2 的 MSH、PID、PV1、OBR、OBX 等段，提取患者人口学信息、检验结果、诊断和用药；解析 FHIR R4 的 Patient、Observation、Condition、MedicationRequest 资源；将 HL7v2 消息转换为 CSV 或 pandas DataFrame；遍历并展平 FHIR Bundle；执行完整性、日期校验和代码系统验证等数据质量检查。\n\n使用方式：当用户要求解析 HL7v2 消息或批量文件、从 FHIR 提取临床数据、转换为表格、展平 Bundle 或运行质量检查时调用。使用前需安装依赖：\n\npip install python-hl7 fhir.resources pandas\n\nHL7v2 使用 python-hl7 解析后按段和字段访问；FHIR 使用 fhir.resources 的 model_validate 解析，按系统 URI 而非数组位置提取编码，并注意 choice 类型（如 valueQuantity 与 valueCodeableConcept）。\n\n限制：不涵盖 HL7v3/CDA 解析、FHIR 服务器部署、SMART on FHIR 认证及实时消息路由。资料中的具体代码示例、字段对照表和常见错误清单需参考原技能文档。暂未提供收费、平台支持或效果方面的信息。