该技能用于在 AWS HealthOmics 上创建、部署并运行生物信息学工作流，面向不一定深谙技术的用户，由智能体逐步引导决策。
用途：确认分析目标（分析类型、物种、数据格式），推荐工具与流程并获得确认，选择工作流语言，搭建基础设施，生成工作流代码，注册运行并监控，处理失败，交付结果。资料给出的常见分析类型包括质量控制（FastQC、MultiQC、fastp）、比对（BWA-MEM2、STAR、minimap2、bowtie2）、变异检测（GATK HaplotypeCaller、DeepVariant 等）、结构变异、RNA-Seq、甲基化、变异注释、联合基因分型与体细胞检测，并给出整基因组、RNA-Seq、靶向/外显子等组合建议。
主要能力：Mindset 上 HealthOmics 为全托管服务，用户提供工作流定义（Nextflow 或 WDL）、ECR 中的容器镜像、S3 输入数据与 IAM 服务角色。工作流语言默认简单流程用 WDL 1.1、复杂多样本 scatter-gather 用 Nextflow DSL2。容器优先 quay.io/biocontainers，其次 public.ecr.aws 与 Docker Hub；HealthOmics 要求容器在私有 ECR，可用 pull-through cache 镜像公共镜像，Docker Hub 需 Secrets Manager 凭证。可用 MCP 工具完成创建缓存、校验 ECR 配置、检查容器可用性、克隆镜像、创建容器注册表映射、lint、打包、注册、启动运行、监控与诊断失败。
使用方式：前置条件为配置受支持区域的 AWS 凭证、安装 AWS CLI v2、启用 HealthOmics MCP（aws-healthomics power），可选 RODA MCP 查找测试数据；首次需创建 S3 桶、带 omics.amazonaws.com 信任策略的服务角色、运行缓存并写入 .healthomics/config.toml。运行通过 StartAHORun 传入 workflow_id、role_arn、output_uri、parameters 等，缓存 ID 由配置或 ListAHORunCaches 自动解析。
限制：容器须在私有 ECR，输入输出须在 S3 且与工作流同区域，需服务角色；支持区域限于 us-east-1、us-east-2、us-west-2、eu-west-1、eu-west-2、eu-central-1、ap-southeast-1、ap-northeast-1、ap-northeast-2、il-central-1；每任务至少 2 CPU、4 GB 内存，Nextflow publishDir 须以 /mnt/workflow/pubdir 为基础，命令块用 set -eu。价格与性能数据暂未提供。