SuperAPI AI 工具集

find-cohort-gap

写作与研究

查看项目

更新于 10-15 16:51

技能介绍

用途:当需要为纵向队列数据库寻找可回答的研究选题时使用,适用于NHIS、UK Biobank、机构EMR或登记库等队列。输出目录由用户指定,默认当前工作目录。

主要能力与流程: 阶段0队列录入:可按公开文献填充队列画像,或对本地码本/数据字典/CSV导出运行输入适配器。适配器命令示例:python3 "${CLAUDE_SKILL_DIR}/scripts/build_cohort_profile.py" --codebook data_dictionary.csv --context narrative_review.pdf --context https://example.org/guideline --cohort-name "Institutional CT registry" --out-dir . 支持.csv/.tsv/.json/.md/.txt,.xlsx需openpyxl,.pdf需pdftotext。生成cohort_profile.md、cohort_profile.json与context_extract.md。样本量、时间跨度、局限、既有发表、IRB状态等码本不含的信息会标记为[UNKNOWN],需向用户确认。 阶段1 PI画像:有PI时检索PubMed近5年发表,构建关键词图。 阶段2交叉矩阵:将队列变量簇与PI专长交叉评分0-3,生成20-40个PICO候选,并按第一作者学科过滤。 阶段3文献饱和度扫描:用PubMed查询计数并分级(Blue Ocean/Green Field/Yellow/Red),执行“So What”测试。 阶段4六模式评分:P1纵向优势、P2终点升级、P3队列独特性、P4 PI-选题匹配、P5对比表差距、P6互补设计,总分5-6建议顶级期刊、3-4专科期刊、0-2重构或放弃。 阶段5可行性门:检查样本量、缺失数据、随访时长、操作定义、IRB等,给出Go/Conditional Go/No-Go。 阶段6输出:排名汇总表与一页方案,保存为gap_proposal_{rank}_{short_topic}.md,可衔接/design-study与/write-paper。

限制:码本需由适配器逐字枚举,不可自行改写摘要;未标注来源的临床定义需标[VERIFY];既有文献须有/search-lit确认的DOI或PMID,否则标[UNVERIFIED]。